في إطار تنفيذ استراتيجية الدولة وفقا للدستور المصري المادة رقم (18) التي تنص على "لكل مواطن الحق في الصحة وفي الرعاية الصحية المتكاملة وفقا لمعايير الجودة ووفقا للهدف الثالث من اهداف التنمية المستدامة للأمم المتحدة، وتكفل الدولة الحفاظ على مرافق الخدمات الصحية العامة التي تقدم خدماتها للشعب ودعمها والعمل على رفع كفاءتها وانتشارها الجغرافي العادل".
وفى ضوء سعى الدولة لتطوير المنظومة الصحية المصرية وتحسين الخدمات الصحية العامة تم إطلاق عدد من المبادرات الرئاسية تهدف إلى إنشاء نظام تأمين صحي شامل، وتحسين أداء التعليم الطبي ورفع المستوى المعيشي لأعضاء المهن الطبية في مصر، ويأتي قانون إنشاء المجلس الصحي المصري كخطوة جديدة هامة ضمن أحد الخطوات التي اتخذتها الدولة لتحسين المنظومة الصحية المصرية.
وفي إطار هذه التوجه فقد صدور قانون رقم 12 لسنة 2022 بإنشاء المجلس الصحي المصري كهيئة عامة خدمية، ويكون لها الشخصية الاعتبارية، وتتبع رئيس الجمهورية، ويكون مقرها الرئيسي مدينة القاهرة، وتعتبر إدارة الخدمات الطبية العسكرية للقوات المسلحة )الأكاديمية الطبية العسكرية، كلية الطب بالقوات المسلحة( أحد فروع المجلس وتسري احكام القانون على جميع خريجي كليات القطاع الصحي وهي كليات الطب البشري ، الأسنان ، الصيدلة ، العلاج الطبيعي ، التمريض والطب البيطري وغيرها من التخصصات الصحية الأخرى التي يصدر بها قرار من رئيس مجلس الوزراء ويجوز للمجلس إنشاء فروع في المحافظات، ويحل محل الهيئة المصرية للتدريب الإلزامي للأطباء المنشأة بقرار رقم 210 لسنة 2016 ويتولى أداره المجلس كلا من مجلس الأمناء ،مجلس الأداره ، والأمانة العامة .